قد يكون اختيار نظام TEM المناسب لمهمة معينة أمراً صعباً. فدقة النموذج وعمق الفحص (DOI) لا يعتمدان فقط على تكوين النظام، بل يعتمدان أيضاً على مستويات الضوضاء الخلفية وبنية المقاومة الكهربائية تحت السطح. ويجمع برنامج TEManalyze كل هذه المعلمات معاً، مما يساعد المستخدمين على اتخاذ قرارات مستنيرة قبل التوجه إلى الميدان.
باستخدام TEManalyze، يمكن للمستخدمين تحديد نظام TEM وتكوينه الأنسب، وتحديد الوقت الأمثل للتكديس، وتقييم الدقة القابلة للتحقيق ومؤشر DOI (DOI) بالاعتماد فقط على المعرفة الأساسية بمقاومات الطبقات وسماكتها المتوقعة.